Author Archives: katrine

På dagsturstokt med F/F “Hans Brattstrøm”

I går hadde vi en usedvanlig fin jobbmandag – vi dro på tokt!

F/F Hans Brattstrøm, en av UiB's båter

F/F “Hans Brattstrøm”, en av UiB’s forskningsfartøy – i forgrunnen ses “Aurelia”

IMGP0059Strålende sol og speilblank fjord gav en riktig så fin ramme rundt jakten på dyr vi kan barcode – i dette tilfellet primært børstemark (Polychaeta) og “boblesnegler” (Orden Cephalaspidea).

Vi siktet oss inn på lokaliteter med sandbunn i Lysefjorden (Hordaland), da disse har en fauna vi ønsket oss flere individer i fra – men det er ikke alltid like enkelt å treffe flekkene med sand, så vi fikk også med oss noen stasjoner med stortare (Laminaria hyperborea), og et par grabbhugg i mudder.

Pørven ble samlet med grabb

Prøvene ble samlet med grabb…

..og med ringskrape

..og med ringskrape

Innkommende grabb

Innkommende grabb

Når prøven kommer på dekk blir den vasket gjennom sikter med ulik diameter

Når prøven kommer på dekk blir den vasket gjennom sikter med ulik diameter

Og (om vær og vind tillater det) så grovsorterer vi litt på dekk - i går var det som sagt veldig, veldig fint å være marinbiolog!

Og (om vær og vind tillater det) så grovsorterer vi litt på dekk – i går var det som sagt veldig, veldig fint å være marinbiolog!

Plukke, plukke - ved å sortere litt ombord får vi en ide om hvilke dyregrupper vi har fått med oss

Plukke, plukke – ved å sortere litt ombord får vi en ide om hvilke dyregrupper vi har fått med oss. De fleste av dyrene vi jobber med må vi dog  få under lupe og mikroskop før de kan artsbestemmes.

Porania

Porania pulvillus (?)

Kråkeboller

Kråkeboller

Et utvalg i fra tareskogen

Et utvalg i fra tareskogen

Totalen ble 15  bøtter i fra seks stasjoner i Lysefjorden (Hordaland) - så nå er det full rulle på laben med sortering og fotografering!

Totalen ble 15 bøtter i fra seks stasjoner i Lysefjorden (Hordaland) – så nå er det full rulle på laben med sortering og fotografering!

NorBOL-workshop i Trondheim

IMG_8196Denne uka har tre av oss vært i trivelige Trøndelag på workshop ved Vitenskapsmuseet, NTNU sammen med andre biologer i fra hele landet. IMG_8203

Tema for workshopen var barcoding gjennom NorBOL-prosjektet.

 

Vi var omkring 15 deltagere som abeidet med våre medbrakte prøver i fra et vidt spekter av dyr og planter (botanikere driver med barcoding, de også!), deltok på foredrag og hadde interessante diskusjoner.

Takk til Torbjørn, Lisa og deres gode hjelpere for en flott workshop!

 

P1020692 P1020700 IMG_8207P1020696

10 plater klare til sending!

Nå har vi fått ferdig ti plater til barcoding (hurra!), ni i fra norske farvann som inngår i NorBOL-prosjektet, og en plate med børstemark i fra vestkysten av Afrika (MIWA-bloggen er forøvrig nylig oppdatert). Disse platene skal sendes til Canada for videre prosessering.

Gruppene vi har arbeidet med nå er:

Et helt brett med amphipoder (tanglus), primært samlet inn av MAREANO, men med innslag i fra Svalbard

Et helt brett med amphipoder (tanglopper), primært samlet inn av MAREANO, men med innslag i fra Svalbard

1..

1..

2...

2…

3...

3…

..4 brett med børstemark ifra norske farvann. Dyrene kommer i stor grad i fra MAREANO og BIOSKAG, og har blitt opparbeidet på ulike workshoper vi har arrangert.

..4 brett med børstemark ifra norske farvann. Dyrene kommer i stor grad i fra MAREANO, BIOSKAG og POLYSKAG, og har blitt opparbeidet på ulike workshoper vi har arrangert.

Ett brett med aplacophora (pelsmollusker)

Ett brett med aplacophora (pelsmollusker)

Ett brett med Ophiuroidea (slangestjerner) samlet inn av MAREANO; BIOSKAG og våre egne tokt

Ett brett med Ophiuroidea (slangestjerner) samlet inn av MAREANO; BIOSKAG og våre egne tokt

Ett helt brett med Cumacea (kommakreps)

Ett helt brett med Cumacea (kommakreps)…

Samt et brett med Cumacea (t.h.), Mysida (t.v)(pungreker/rekebarn) og Isopoda (tanglus, øvre bilde)

Samt et brett med Cumacea (t.h.), Mysida (t.v, pungreker/rekebarn) og Isopoda (tanglus, øvre bilde) i fra Norge.

Og et brett med afrikanske børstemark

I tillegg sender vi nok et brett med afrikanske børstemark

Vi sender dem avgårde og krysser fingrene for strålende resultater og mengder av fine barcodes!

 

 

 

 

Nede på bunnen i det mørke hav…

Vi ruller videre med DNA-barcoding av norske, marine evertebrater i regi av NorBOL – og du verden så mye kult vi får jobbe med! Her er et lite utvalg av det som har gått gjennom prosessen mot udødelighet i databasen til BOLD (Biodiversity of Life) i det siste.

Spennende dyreliv!

Spennende dyreliv! Foto: Kongshavn

Prosessen er som før; dyr identifiseres av taksonomer som kan den aktuelle gruppen (det være seg kommakreps, tanglopper, børstemark eller pelsmollusker).

Pelsmollusk, eller Aplacophora.

Pelsmollusk, eller Aplacophora.

Plukke, plukke

Plukke, plukke

Et representativt individ plukkes ut til en fremtid som barcodingsvoucher. Dette dyret blir så fotografert, og en vevsbit blir tatt ut. Resten av dyret får katalognummer og blir en del av museumssamlingen. De utplukkede vevsbitene samles i spesielle plater med plass til 95 prøver, og platene sendes til Canada (fordi det er dem vi har avtale med). Der prosesseres vevet på en slik måte at vi – om alt går etter planen – får ut en bit (barcode) av arvestoffet (DNA) som er artsspesifikk.

Deretter legges all informasjonen om dyret – hvilken art det er, hvem som har artsbestemt det, hvor dyret ble samlet inn (koordinater og dyp), bilde av individet og den genetiske strekkoden –  inn i databasen til BOLD.

En ferdig fylt plate med vevsprøver av 95 dyr

En ferdig fylt plate med vevsprøver av 95 dyr