Category Archives: Studentprosjekter

Doktogradsdiputas fredag 7. februar 2025

Miguel Angel Meca Jimenez disputerer 7.2.2025 for ph.d.-graden ved Universitetet i Bergen med avhandlingen “Systematic revision of Orbiniidae (Annelida)”.

Dette kan du lese mer om her: Revisjon av systematikken til leddormer (annelider) basert på morfologi og gener | Nye doktorgrader | UiB

Evertebratsamlingen gleder seg sammen med Miguel og hovedveileder Nataliya, og ønsker lykke til på disputasen!

Opponenter:
Doctor Ekin Tilik, Seckenberg research institute, Frankfurt, Germany
Doctor Helena Wiklund, University of Gothenburg, Sweden

Leder av komiteen
Professor Egil Erlingsson Karlsbakk

Disputasleder
Professor emeritus Harald Kryvi

Tid: 07.2.2025 – 10.15–13.00
Sted: Høyteknologisenteret, Lille auditorium

Åpent for alle interesserte.

Feltarbeid fra Torsvåg fyr (Troms)

Kart over Norge med markør på Torsvåg, litt nord for Tromsø

Her ligger Torsvåg! (norgeskart.no)

 

Den siste uka har det nok vært stillere enn vanlig i gangene på avdeling for naturhistorie; hele 11 av «de marine» har vært på feltarbeid sammen, langt mot nord.

Med base i Torsvåg har vi samlet materiale til en hel drøss med kartleggingsprosjekter støttet av Artsprosjektet.

Gruppebilde av 11 personer ved havet.

Universitetsmuseet sine folk. Bak f.v.: Joan, Jon, Tom, Nataliya, Katrine, Cessa, og Marta (partner i NOAH). Fremre rad f.v.: Lea, Luis, Eva og Praveen.

kollasj v fire bilder; to store som viser et hvitt fyrtårn i fit vær, og to som viser diverse utstyr utenfor en blå brakkerigg

Torsvåg fyr fra to himmelretninger, og tegn på at en har marinbiologer i hus. Foto: K. Kongshavn

Feltarbeidet kom opprinnelig i stand som et samarbeid mellom prosjektene Norske Marine Sopper (Teppo Rämä, UiT), NOAH – Norske Arktiske Hydrozoer (Joan J. Soto-Àngel, UMB) og Leddormer i Arktis (ManDAriN) (Nataliya Budaeva, UMB).

I tillegg var prosjektene Bløtdyrsgruppen lavere Heterobranchia, Parasitter på maneter, kammaneter og pilormer – ParaZoo, Digitalisering av norske bryozoa (NorDigBryo) og Marine Amfipodar: Diversitet, Artskompleks og Molekylære studiar (MADAM) representert (mange av oss er deltagere i flere prosjekter) – så vi dekket et vidt spekter av organismer!

børestemark, snegl, og tangloppe på svart bakgrunn, en lupe og et skjermbilde med foto av en manet og teksten "want?"

Noen av dyrene vi arbeidet med. På dette feltarbeidet har vi fokusert mye på å dokumentere dem i live, da mange mister farger og andre karaktertrekk raskt etter fiksering. Foto. k.Kongshavn

Værmessig hadde Bergenskontigenten litt bange anelser der vi sto og pakket bilen i nesten 30 grader, mens snøen lavet i nord – men det viste seg at vi hadde godvær i vente! Innen vi hadde kommet oss i hus så var «pinseria» over og solen dukket frem – og for en fantastisk natur vi befant oss i!

Bilder av sommer i bergen og snø i nord, og et skjermbilde i fra nrk.no om "pinseria"

Værforskjell i sør og nord – som heldigvis ble utlignet i løpet av uka! Skjermbilder fra yr.no og nrk.no, flyfoto K. Kongshavn.

Tidevannspytter i midnattssol

Første innsamling ble på kvelden samme dag som vi kom – her er vi ute i tidevannspyttene like ved fyret, på kveldens lavvann. Foto: K. Kongshavn

Vel fremme på Torsvåg fyr dekket Teppo opp med pannekaker og strategimøte – og før kvelden var omme hadde vi de første prøvene i sving på laben. Deretter gikk det slag i slag, med innsamling i tidevannspytter, fra brygger og marinaer, i tareskog og fra båt. Vi hadde en dag med suboptimalt vær hvor det var for mye vind til å få gjort stort ute, men vi hadde da absolutt nok materiale å jobbe med inne.

Ulike metoder for innsamling vist i en kollasj. Her er folk på brygga og i vannet, en liten grabb, sikting av prøver, og en håv i solnedgang.

Ulike innsamlingsmetoder, mange av dem gav prøver for flere prosjekter. Foto: K. Kongshavn

Vi var totalt 14 personer, fordelt på fyret og to brakkeleiligheter. Labplass ble rigget for sopp oppe på fyret, og i de to leilighetene regjerte «team nesledyr & ctenophora», og «team bentos» (børstemark, snegler, mosdyr og amfipoder). Her ble det sortert, identifisert, fotografert og dokumentert – med mye migrering av prøver mellom de ulike labene etter hvert som vi fant ting som var av interesse for hverandre. Vi fikk også hyggelig besøk i fra Artsdatabanken, som fikk være med de ulike prosjektene på innsamling og lab-arbeid. Her kommer det etter hvert en nyhetssak, vi deler link når den er ute.

Vi hadde en ekstremt produktiv uke, og alle prosjektene fikk fatt i spennende materiale som vi skal jobbe videre med nå.

Tusen takk til alle for strålende godt humør, vilje til å dele kunnskap, prøver og båttid, for deilig mat – dette må vi gjøre flere ganger* 😊

Følg med for flere poster i fra de ulike prosjektene (antakelig mest på den engelske bloggen (link), siden vi hadde åtte(!) nasjonaliteter med)

-Katrine, på vegne av den marine gjengen

*vi gjorde noe tilsvarende (litt mer kortreist) i 2020 – da dro vi til Kilstraumen, det kan du lese mer om her

Studentbesøk: Tiril

I november og desember har vi hatt mange besøkende på laben. En av dem er Tiril, som er femte masterstudent ut på Hardbunnsfauna-prosjektet, med base på NTNU Vitenskapsmuseet. Hun forteller: 

Som masterstudent i Hardbunnsfauna-prosjektet får man lære masse nytt!
I mitt prosjekt ser jeg på ascidier, også kjent som sekkdyr eller sjøpung. Dette er en gruppe ryggstrengdyr som folk flest ikke vet noe særlig om – det gjaldt også meg selv før jeg begynte med oppgaven. Som larver svømmer de rundt som små rumpetroll før de bunnslår og omdanner kroppen helt til en slags filtrerende sekk. Siden de voksne dyrene er fullstendig tilpasset en filtrerende livsstil, gjorde det at man ikke gjenkjente sekkdyr som ryggstrengdyr før 1867, og de var frem til da antatt å tilhøre bløtdyrene. Til tross for at man vet mer nå enn før, så er det fortsatt en understudert gruppe med mange problemer å studere nærmere.

I min oppgave ser jeg på grupper hvor det er taksonomiske utfordringer. I flere tilfeller er det slik at genetiske undersøkelser med DNA-barcoding finner større variasjon enn antatt fra morfologi, og man kan da mistenke at det finnes flere arter enn det som er registrert. Tilfeller av dette finnes i slektene Ascidiella og Botryllus, hvor førstnevnte har to kjente arter i Norske vann (A. aspersa og A. scabra) og den siste har én kjent art (B. schlosseri), hvor begge slektene har flere genetiske klader på genet COI.

Innsamling av sekkdyr på Glesvær utenfor Bergen. Mange ulike arter, både solitære og kolonidannende! Foto: Tiril S. Mathisen

En litt annen side av samme sak er at vi har slekter hvor det er registrert flere arter, men de er vanskelige å identifisere og skille fra hverandre med morfologi. Dette gjelder slektene Botrylloides og Didemnum. I disse slektene er det også registrert arter som ikke hører hjemme i Norske vann, såkalte fremmedarter, som kan være skadelige for norsk natur. I førstnevnte slekt mistenkes det feilidentifisering på grunn av at gruppen er krevende å identifisere samt mangelfull litteratur, slik at utbredelsen trolig er større enn registrert. Ved å gjøre morfologiske undersøkelser og sammenlikne med resultater fra DNA-barcoding, kan forhåpentlig bedre trekk dokumenteres, og gjøre identifikasjon enklere for forskere og vanlige folk, i tillegg til å få bedre oversikt over utbredelsen. I Didemnum er artsidentifisering med morfologi krevende, men det er også vanskelig med molekylære undersøkelser, så her har vi lyst til å få noen gode DNA-sekvenser.

Botryllus schlosseri og Botrylloides leachii side om side på et blåskjell. Hvert ‘kronblad’ i de blomsterliknende strukturene er et individ, kalt zooider. Foto: Tiril S. Mathisen

En isolert zooide fra en koloni av Botrylloides leachii. Dette må gjøres for identifisering av arter. Denne er mellom 1 og 2 mm stor. Foto: Tiril S. Mathisen

Under oppholdet mitt i Bergen samlet vi inn levende materiale og studerte det under stereolupe på laboratoriet. Her fikk jeg god hjelp fra eksperter på gruppen, som var utrolig lærerikt! Fra dette materialet og materiale fra museumssamlingene, tok jeg vevsprøver som ble tatt med til DNA-laben. Der lærte jeg å gjøre DNA-barcoding, og det var gøy å være med på hele prosessen fra levende dyr i havet til DNA-sekvenser på PCen. Nå gjenstår det å tolke resultater og skrive oppgaven. Tusen takk for meg!

-Tiril

Hardbunnsfauna 2021 – årskavalkade

Jeg har rett og slett valgt ut en post fra hver måned i 2021 på Instagram-kontoen til Hardbunnsfauna og brukt det som en kjapp oppsummering på noe av det vi har gjort i år.

Klikk på bildene for å se dem i full størrelse

Følg oss gjerne på @hardbunnfauna!
(samme brukernavn på twitter også)

Januar: Året begynte godt, med feltarbeid i strålende vintervær

Februar: Rapporten vår i fra feltarbeid i Saltstraumen ble publisert

Mars: Workshop-uke på Espegrend sammen med NorChitons og HypCop

April: Barcoding av svamp er i gang, og vi begynner å få resultater på det vi har levert til sekvensering

Mai: Flere prøver til genetisk strekkoding (DNA barcoding), her holdt vi på med små snegler

Juni: Prosjektets første masterstudent fullfører oppgaven sin og gjør en kjempejobb!

Juli: Fjærebingo på vei inn mot fellesferien – vi hørte fra flere som fikk bingo!

August: Feltarbeid i Puddefjorden i forbindelse med SUB sin opprydningsaksjon

September: Deltagelse på stand ute på Os sammen med Havkollektivet

Oktober: Katrine er på tokt med Marano, og poster derfor ikke så mye (dårlig dekning ute til havs) – men det samles kjempespennende prøver til prosjektet, for Mareano går grunnere enn de pleier

November: Vi drar til Haugesund i Halloweenhelga for å være med Slettaa Dykkerklubb når de arrangerer marinbiologikurs

Desember: Innspurt på alle fronter og mange prosjekter som skal rapporteres på – men vi får noen trivelige julegaver i posten (både fysisk og elektronisk) fra ulike folkeforskere – tusen takk!

-Katrine

Sommerkavalkade

Det har vært stille på bloggen dette semesteret – det skyldes delvis at det har vært veldig mye som har blitt publisert på den engelske bloggen (https://invertebrate.w.uib.no/) eller på sosiale medier*, og delvis at vi rett og slett har hatt det travelt!

Koronaen har som kjent gått sin skjeve gang i bølger opp og ned, og vi har – i likhet med de fleste andre – vært mest på hjemmekontor, med litt høyst nødvendig labarbeid innimellom. Nå er det lettet på mange av tiltakene, så de fleste fikk noen uker på kontoret før sommerferien – stor stas å se kollegaer igjen på ekte!

Det har vært begrenset anledning til feltarbeid og å samle større grupper, men en god gjeng kom seg til Sognefjorden i mai. Her var prosjektene AnDeepNor, HypCop, NorHydro og Hardbunnsfauna deltagere.

Team Sognefjord – deltagere fra prosjektene Norhydro, HYPCOP, Hardbunnsfauna og AndeepNor

Hardbunnsfauna (som jeg har best oversikt på, så det blir mest om det her) har startet arbeidet med strekkoding av svamp (Porifera) og mosdyr (Bryozoa), i tillegg til å fortsette kartleggingen av «alt» på grunn hardbunn (nesten, i alle fall! Vi overlater de minste hoppekrepsene til HypCop, leddsneglene til NorChitons, og hydrozoene til NorHydro).

Mosdyr, eller Bryozoa, som vi har sendt prøver av til DNA barcoding/genetisk stekkoding slik at de kan bli en del av NorBOL-biblioteket over arter som finnes i Norge (Fotos: JAK)

Svamp i fra grunt vann – det er ikke alltid helt enkelt å få lurt en genetisk strekkode utav disse, men så langt ser det lovende ut! (Fotos: K. Kongshavn og F. Carvalho)

Vi har også gjort mye arbeid på ulike sneglearter, både på grunt vann og i fra dypere (da mye Mareano-materiale). Denne gjengen er ganske grunne – kanskje treffer du dem i sommer?  Fotos: K. Kongshavn

Det begynner å bli en god del spennende resultater her!

 

Spennende resultater fikk også August, masterstudenten vår (han skrev en post om hva han studerte her), som leverte en knallgod oppgave i mai.

Den fikk tittelen “Using morphology and DNA barcoding to assess species diversity within the isopod genera Jaera, Janira, and Idotea in Norway”. Til høsten starter flere nye studenter** opp med oppgaver knyttet til Hardbunnsfauna-prosjektet, det blir spennende!

Apro pro studenter; gå ikke glipp av de fine bloggpostene Lara, en av studentene på NorHydro-prosjektet, har skrevet på engelsk!

What’s growing on the shell? – Insights into the Diversity of Hydractiniidae in Norway

On the Hunt for Tiny Polyps

Illustrasjon av livssyklusen hos hydractiniider, som kan inkluder ebåde polypp- og medusastadie. Grafikk av Lara Beckmann

Følg oss gjerne på *sosiale medier;

Hardbunnsfauna, som egentlig heter «Evertebratfauna på grunne hardbunnshabitater: Artskartlegging og DNA strekkoding», har hjemmesideTwitter, og Instagram.

NorChitons, “Leddsnegler i Norge”, har hjemmeside,  Twitter og Instagram.

NorHydro, «Norske marine bentiske hydrozoa (polyppdyr)», finnes på Twitter med #NorHydro, og i facebookgruppen Hydrozoan Science.

HYPCOP, «Hoppekreps i hyperbenthos», har hjemmesideTwitterInstagram og facebookgruppe.

-Katrine

(**Om noen flere skulle ha lyst på en masteroppgave med oss på museet så ta kontakt! Send Katrine en epost så kan hun sende dere videre til rette vedkommende. Vi dekker alt fra hoppekreps til hai på det marine 😉)