Maitokt 2018

Onsdag i forrige uke var vi ute med R/V Hans Brattstrøm i fjordene rundt Bergen.

Vi skulle samle nye amphipodprøver til Chistine sin masteroppgave (som er en del av Artsprosjektet NorAmph), Hydrozoa til artsprosjektet HYPNO, og nye prøver til NorBOL.

Det er mye liv i sjøen!

Det var folksomt ombord denne gangen; I tillegg til tre fra avdelingen og masterstudent Christine vi hadde med oss to niendeklassinger på arbeidsuke. Trivelig, og veldig effektivt med så mange hender!

I løpet av uka fikk de et innblikk i ulike aktiviteter ved evertebratavdelingen gjennom å være med på DNA-laben, sortere og fotografere dyr i fra prøver, denne dagen i felt, studering av levende planktonprøver i lupa, og noen timer på scanningelektronmikroskopet.

Et av dyrene vi fanget (en amphipod) fotografert: først i lupe med stacking av flere bilder oppå hverandre for størst mulig bildedybde, og videre forstørret i elektronmikroskopet (fotos: K.Kongshavn)

Vi hadde en fin dag på tokt, og fikk samlet to slede- og planktontrekk, og grabbhugg i fra to stasjoner. Vi fortsetter på sorteringsjobben, og plukker spennende dyr til de respektive prosjektene.

Takk for besøket og for hjelpen til gutta, det var kjekt å ha dere her!

Genomer hos skallfrie bløtdyr (Mollusca, Aplacophora)

Pelsmollusker eller ormebløtdyr (Aplacophora) er en relativt lite kjent gruppe med mange ubeskrevne arter i norske farvann. I en tidligere blogpost her finnes mer informasjon om disse dyrene:

https://evertebrat.w.uib.no/tag/pelsmollusk/.

Mange hypoteser finnes om slektskapet mellom Aplacophora og de øvrige bløtdyrene.  Det er usikkerheten om dette som vår PhD-student Nina Mikkelsen og medforfattere forsøker å finne ut av med data fra mitkondriegenomer. Arbeidet publiseres i Molecular Phylogenetics and Evolution og er tilgjengelig på denne lenken: https://doi.org/10.1016/j.ympev.2018.04.031.

Innsamling av tarefauna

Institutt for biovitenskap (tidl. institutt for biologi) arrangerer feltkurs i marin flora (BIO309) ute på Espegrend marinbiologiske stasjon i disse dager. Som en del av kurset drar studentene ut med R/V Hans Brattstrøm og samler inn makroalger som de tar med seg tilbake på laben for å studere nærmere. Katrine har vært med på dette kurset tidligere og plukket zoologi av algene – det fristet til gjentagelse, så i går gikk ferden ut for å bli med på innsamling og skattejakt i prøvene.

Konsensus var at det slett ikke er så verst å være i felt! På det største bildet har båten lagt til kai, men ingen gjorde tegn til å ville gå av 🙂

Manuel og vår nyeste ph.d. student, Justine, ble også med ut, for å se om de kunne finne nakensnegler på algene – dette blir en del av Artsprosjektet på Nakensnegler i Sør-Norge som starter opp nå i mai (og siden vi diskuterte dette ganske mye i går; “nakensnegler” er altså mer enn kun nudibranchia, det omfatter  ordene Anaspidea, Nudibranchia, Pleurobrancomorpha, og Sacoglossa).

Bildene taler for seg selv, det var en strålende dag å være i felt – og vi fikk fine prøver!

Takk for at vi fikk henge oss på, og lykke til med resten av kurset!

-Katrine

Ny NorBOL-forsendelse

Barcodingsplate med vevsprøver

Når vi sender (vevs)prøver til analyse ved laboratoriet i Canada som NorBOL har avtale med, så samles disse prøvene i spesielle plater med plass til 95 prøver.

Disse platene går inn i et automatisert løp på laben, og må derfor fylles med prøver fra organismer som kan behandles likt.

 

Dermed kan vi ikke blande alle mulige dyregrupper, som f.eks. fisk og fluer, på en plate. Dette gir oss noen utfordringer når det kommer til å få fylt plater med artsidentifiserte, riktig fikserte prøver innenfor rammene av NorBOL, som har finansiering til strekkoding av 4 individer i fra hver art.

Eksempelvis så var den ene av de ti platene vi sendte nå en vi begynte på høsten 2016, da vi var på feltarbeid på Sletvik utenfor Trondheim – siden da har vi samlet og identifisert nesledyr (Cnidaria) hver gang vi har hatt feltarbeid, og nå hadde vi endelig nok dyr til en plate.

Vi (Katrine) koordinerer strekkodingen av marine organismer her ved Universitetsmuseet i Bergen, men det er ikke bare marine dyr og alger det arbeides med; i denne forsendelsen var det ti plater, hvorav fem var marine, og fem var terrestre (landlevende).

Fra øverst til venstre, fotograf i ( ): Hydrozoa (L. Martell), Echinodermata (K. Kongshavn), Copepoda (T. Falkenhaug), Polychaeta (K. Kongshavn), Insecta (S. Roth), Oribatida (A. Seniczak) og Cnidaria (K.Kongshavn)

Av de marine så sendte vi den nevnte platen med assorterte nesledyr – mest anemoner, og en plate med Hydrozoa, som også er nesledyr. Sistnevnte er en del av Artsprosjektet på småmaneter og kolonimaneter, her på huset kjent som HYPNO.

Vi sendte også en plate med børstemark (polychaeta), og en med pigghuder (echinodermata) – hva vi jobber med der kan du lese mer om her. Den siste marine platen var fylt med DNA i fra Hoppekrepser og vannlopper (COPCLAD), og er en del av artsprosjektet til en kollega på Havforskningsinstituttet.

De fem platene med terrestre dyr kom i fra to artsprosjeketer: to plater var fylt med insekter samlet i Hedmark som en del av artsprosjektet Insekter på rikmyrer i Hedmark (som også har en fin blogg).

De siste tre (!) platene kom i fra et nyoppstartet artsprosjekt på Hornmidd i varmekjære løvskoger, her blir det veldig spennende å se hvor godt strekkodingen fungerer!

Vi håper på flotte resultater!

-Katrine