Author Archives: katrine

Elektronmikroskopi

Vi er så heldige å ha elektronmikroskopisk felleslaboratorium (EFL) rett borti gangen i fra laben vår på Realfagsbygget, og avdelingen benytter seg flittig av fasilitetene der. Disse inkluderer både transmisjonmikroskop (TEM) og elektronmikroskop (SEM).

Her bruker Katrine og Nataliya elektronmikroskopet (en ZEISS Supra 55VP) til å undersøke og dokumentere en polychaet (børstemark) samlet inn av Senter for GeoBiologi ved en av de hydrotermale skorsteinene på havbunnen (du kan lese mer om dette på hjemmesidene til GeoBio).

Som vi har vist tidligere på bloggen så kan man ta svært gode bilder i høy forstørrelse med et slikt mikroskop, og disse bildene kan brukes i prosessen med å beskrive (nye) arter.

Flere vestafrikanske dyregrupper

Som nevnt i en tidligere post arbeider vi for tiden en god del med materiale samlet inn langs vestkysten av Afrika.

I tillegg til krabbene (Brachyura) i forrige post så holder vi på med flere ulike familier av børstemark (Polychaeta), og med slangestjerner (Ophiuroidea). Her er bilder av noen av dyrene som har “vært hos fotografen” denne uka, dette er en del av prossesen for å klargjøre materialet for inludering i BOLD-databasen. Vi begynner med å få dyrene artsbestemt av en taksonom som kjenner gruppen, deretter tas det bilde og en vevsprøve, som så sendes til Canada for sekvensering slik at vi får en genetisk “barcode”, en artsspesifikk identitetskode. Dette blir så gjort tilgjengelig gjennom databasen BOLD.

En slangestjerne, Ophiura ophiura i fra Marokko. Skala = 0.5 cm

En polychaet i fra familien Maldanidae. Midt på dyret kan du se rester av tuben som det lever i. Skala = 0.5 cm

En annen polychaet, denne hører hjemme i familien Onuphidae og har blitt samlet inn i Guinea. Skala = 0.5 cm

Prosjektoppstart på børstemark

Denne uken er vi på besøk ved Vitenskapsmuseet – NTNU i Trondheim for oppstart av det nye børstemarkprosjektet. Prosjektet handler om kartlegging av diversitet av børstemark i Norskehavet, med spesielt fokus på materiale samlet inn av MAREANO.

Prosjektet heter “Polychaete diversity in the Norwegian Sea – from coast to the deep sea” (PolyNor), og skal gå frem til 2015.

Mer om prosjektet finner du her:

Norsk polychaetforum

Artsprosjektet hos Artsdatabanken

Mareano

Møt katalognummer 90.000

Vi bikket nylig 90.000 katalogiserte prøver i den vitenskapelige samlingen vår, og siden prøve nummer 90.000 er et godt eksempel på hva vi driver med ved avdelingen for tiden så presenterer vi det her.

Diastyloides biplicatus

Dette er en Cumacea (kommakreps eller halekreps på norsk), som har blitt samlet inn av MAREANO. Den ble deretter artsbestemt på en workshop arrangert av Institutt for Biologi og MAREANO (med deltagelse i fra Universitetsmuseet). Nå har den blitt utvalgt til å inngå i NorBOLprosjektet (Norwegian Barcode of Life), hvor den vil inngå i et referansebibliotek av artsspesifikke, standardiserte DNA sekvenser (strekkoder) som skal tjene som en ressurs for forskning og forvaltning av biologisk mangfold i Norge.

Bioskag workshop

Vi kickstartet året med å avholde to workshops i januar. Den første av disse var basert på en del av det omfattende materialet i fra Skagerrak som har blitt samlet inn gjennom de siste par årene (2006-dags dato). Håpet er å øke kunnskapen om den lite kjente evertebratfaunaen i Skagerrak.

I denne omgangen var det flerbørstemarkene (Polychaeta) innsatsen dreide seg om, og i løpet av en hektisk uke var totalt ti deltagere i fra ulike land og institusjoner i sving. Dette kan du lese mer om på bloggen til Norsk polychaetforum. Når driver vi med etterarbeid, og det ser ut for at det etter hvert vil komme mye spennede utav ukas innsats.

Folksomt på laben

En del av etterarbeidet inkluderer å bruke avansert optikk for å studere små detaljer på dyrene. Et av verktøyene vi har til rådighet er elektronmikroskopi; vi har tilgang til fasilitetene til elektronmikroskopisk felleslaboratorium, som gir oss mulighet til å ta høyoppløsningsbilder i stor forstørrelse.

Scanning elektronmikroskopi (SEM) bilde av en Sphaerodoridae. Foto: K. Kongshavn.

Detaljbilde av en børste på en Sphaerodoridae. Foto: K. Kongshavn

Detaljbilde av en børste på en Sphaerodoridae sett ved 7510 x forstørrelse. Foto: K. Kongshavn

Evertebratsamlingen

Universitetsmuseet i Bergen