Category Archives: Pågående prosjekter

10 plater klare til sending!

Nå har vi fått ferdig ti plater til barcoding (hurra!), ni i fra norske farvann som inngår i NorBOL-prosjektet, og en plate med børstemark i fra vestkysten av Afrika (MIWA-bloggen er forøvrig nylig oppdatert). Disse platene skal sendes til Canada for videre prosessering.

Gruppene vi har arbeidet med nå er:

Et helt brett med amphipoder (tanglus), primært samlet inn av MAREANO, men med innslag i fra Svalbard

Et helt brett med amphipoder (tanglopper), primært samlet inn av MAREANO, men med innslag i fra Svalbard

1..

1..

2...

2…

3...

3…

..4 brett med børstemark ifra norske farvann. Dyrene kommer i stor grad i fra MAREANO og BIOSKAG, og har blitt opparbeidet på ulike workshoper vi har arrangert.

..4 brett med børstemark ifra norske farvann. Dyrene kommer i stor grad i fra MAREANO, BIOSKAG og POLYSKAG, og har blitt opparbeidet på ulike workshoper vi har arrangert.

Ett brett med aplacophora (pelsmollusker)

Ett brett med aplacophora (pelsmollusker)

Ett brett med Ophiuroidea (slangestjerner) samlet inn av MAREANO; BIOSKAG og våre egne tokt

Ett brett med Ophiuroidea (slangestjerner) samlet inn av MAREANO; BIOSKAG og våre egne tokt

Ett helt brett med Cumacea (kommakreps)

Ett helt brett med Cumacea (kommakreps)…

Samt et brett med Cumacea (t.h.), Mysida (t.v)(pungreker/rekebarn) og Isopoda (tanglus, øvre bilde)

Samt et brett med Cumacea (t.h.), Mysida (t.v, pungreker/rekebarn) og Isopoda (tanglus, øvre bilde) i fra Norge.

Og et brett med afrikanske børstemark

I tillegg sender vi nok et brett med afrikanske børstemark

Vi sender dem avgårde og krysser fingrene for strålende resultater og mengder av fine barcodes!

 

 

 

 

Nede på bunnen i det mørke hav…

Vi ruller videre med DNA-barcoding av norske, marine evertebrater i regi av NorBOL – og du verden så mye kult vi får jobbe med! Her er et lite utvalg av det som har gått gjennom prosessen mot udødelighet i databasen til BOLD (Biodiversity of Life) i det siste.

Spennende dyreliv!

Spennende dyreliv! Foto: Kongshavn

Prosessen er som før; dyr identifiseres av taksonomer som kan den aktuelle gruppen (det være seg kommakreps, tanglopper, børstemark eller pelsmollusker).

Pelsmollusk, eller Aplacophora.

Pelsmollusk, eller Aplacophora.

Plukke, plukke

Plukke, plukke

Et representativt individ plukkes ut til en fremtid som barcodingsvoucher. Dette dyret blir så fotografert, og en vevsbit blir tatt ut. Resten av dyret får katalognummer og blir en del av museumssamlingen. De utplukkede vevsbitene samles i spesielle plater med plass til 95 prøver, og platene sendes til Canada (fordi det er dem vi har avtale med). Der prosesseres vevet på en slik måte at vi – om alt går etter planen – får ut en bit (barcode) av arvestoffet (DNA) som er artsspesifikk.

Deretter legges all informasjonen om dyret – hvilken art det er, hvem som har artsbestemt det, hvor dyret ble samlet inn (koordinater og dyp), bilde av individet og den genetiske strekkoden –  inn i databasen til BOLD.

En ferdig fylt plate med vevsprøver av 95 dyr

En ferdig fylt plate med vevsprøver av 95 dyr

Fredagsbilder

Red_UMBergen_NB_amph189

En Acanthonotozoma serratum, skala 5 mm, foto K.Kongshavn

Denne uken har stått i tangloppens tegn her på laben, da vi fikk ekspertbesøk på onsdag  som hjalp oss med produksjonen av et brett med vevsprøver av Amphipoda, eller tanglopper som de heter på norsk. Dyrene er primært samlet inn av Mareano, men ispedd et dryss av individer i fra Svalbard. Nå er dyrene identifisert, fotografert og vevsprøver er tatt – så da er det Canada og sekvensering neste for disse småtassene.

Red_UMBergen_NB_amph196

Epimeria loricata, skala 5 mm, foto: K.Kongshavn

 

ps: hvis du tilfedigvis befinner deg i Stavanger førstkommende helg så kan du lære mye nytt om “De stilige tangloppene”!

 

 

Godt nyttår!

Første arbeidsuka i 2014 ble delvis brukt til flyttesjau – nå har vi fått på plass tolv digre stålskap fordelt utover i magasinene, typerommet og på laben.

Det var helt nødvendig med mer hylleplass, da mengden materiale vi jobber med er stadig økende. Og med det var vel dagens årets interiørnyhet dekket her på rosabloggen…!

Scalibregma hanseni

Scalibregma hanseni

 

Av andre nyheter så har en ny artikkel som vi (Jon) har jobbet med har kommet ut, det kan du lese mer om på bloggen til nosk polychaetforum; Scalibregma hanseni, ny børstemarkart i fra Norskehavet. Direktelink til artikkelen finner du her DOI: http://biotaxa.org/Zootaxa/article/view/zootaxa.3753.2.1

 

 

Ophiacantha bidentata samlet inn av MAREANO

Ophiacantha bidentata samlet inn av MAREANO

Vi arbeider videre med DNA-barcoding av marine evertebrater i fra norske farvann, det første brettet med slangestjerner (Ophiuroidea) er snart ferdig fotografert og klart for vevsprøvetaking. Utover vinteren planlegger vi å få klargjort og sendt en hel del plater med vevsprøver til Canada, hvor de prosesseres videre.

Grupper vi så langt vet at vi skal arbeide med inkluderer tanglopper, ulike børstemarkfamilier, ormebløtdyr (Aplacophora), ulike pigghuder, kommakreps og andre krepsdyr. 

Publisitet i Barcode Bulletin

Barcode Bulletin er et nyhetsbrev fra International Barcode of Life (IBOL). I Barcode Bulletin Vol. 4, No. 2 – December 2013 finnes to aktuelle oppslag. Det ene gjelder infrastrukturbevilgningen fra Artsdatabanken og Norges Forskningsråd til NorBol-prosjektet. Det andre refererer til vårt initiativ gjennom IPBES til workshop i MIWA-prosjektet.

barcode_bulletin