Author Archives: katrine

Barcodingsworkshop i Gøteborg

IMG_8471Denne uken har jeg vært på besøk hos kolleger ved Gøteborgs naturhistoriska museum for å hjelpe dem i gang med barcoding av marine evertebrater – de har mottatt ti plater til vevsprøvetakning i fra NorBOL.

IMG_1745Disse platene håper vi å fylle med arter som finnes i både norsk og svensk farvann (landegrensene synes som kjent ikke særlig godt under land, så mye av faunaen overlapper). Dette fungerer også som et pilotprosjekt for en eventuell større satsing på barcoding av svensk materiale (SweBOL), dersom dette får finansiering.

IMG_8465

Vi har gått igjennom prosedyrer og typiske problemstillinger, satt opp fotostasjon, og begynt vevsprøvetakingen på første brett ut, som skal fylles med sjøpølser og andre pigghuder (Echinodermata). Videre håper vi å få tatt en del Bivalver og andre mollusker, da de har mye godt preservert materiale i fra denne gruppen.

Det var et trivelig opphold, og vi ønsker dem lykke til med søknaden for SweBOL!

DNA-strekkoding på NRK, og toktdagbøker i fra MAREANO

schrodingerI går gikk det et kjempefint innslag om DNA-strekkoding (barcoding) på Scrödingers katt på NRK, det kan du se på nett-TV her:

DNA strekkode avslører nye arter

 

 

mareanoSamtidig så avsluttet MAREANO årets siste tokt med bio/geo innsamling. De har vært aktive på nett underveis, her finner du årets siste toktdagbok, som ble laget med en liten vri:

“I dette nyhetsbrevet har alle biologene som er med på “G.O.Sars” på toktet nå i august-september bidratt. Hver biolog har valgt et bilde fra arbeidet sitt, og har skrevet historien til det. Her er mange forskjellige stemmer – og det reflekterer både den store diversiteten vi finner på havbunnen – og den store diversiteten blant biologene om bord”

Nytt dagsturstokt

Helt greit "kontor", det her - flat sjø og blå himmel!

Helt greit “kontor”, det her – flat sjø og blå himmel!

I går var vi ute i sola med F/F “Hans Brattstrøm” igjen, denne gangen på nokså spesifikk jakt etter noen børstemarkarter som vi gjerne skulle hatt mer materiale av – skjønt vi naturligvis plukker med oss “litt av alt” når vi først er ute.

 

Med oss hadde vi to av avdelingens studenter - praktisk felterfaring er viktig å få med seg i løpet av en grad!

Med oss hadde vi to av avdelingens studenter – praktisk felterfaring er viktig å få med seg i løpet av en grad!

 

Med slike små dyr som vi jobber med så er det oftest ikke før en sitter med prøven under lupen at en kan si sikkert om en har funnet det en er ute etter (eller kanskje noe helt annet spennende!), så vi kommer som oftest hjem med bøttevis av materiale – gårsdagen var intet unntak der.

I dag er det frenetisk sortering og fiksering på programmet, og jeg forsøker å få tatt bilder av en del levende dyr, da fargetegningene i stor grad forsvinner i spritfikseringen. Vi plukker dyr direkte til DNA-barcoding, stort ferskere prøver går det ikke an å få !Skattejakt på dekk

Skattejakt på dekk

Et eksempel i fra fangsten; en børstemark i familien Cirratulidae

Et eksempel i fra fangsten; en børstemark i familien Cirratulidae

Sommertravelt

Det er fellesferie og stille i gangene på Museet, men vi som er på jobb har nok å henge fingrene i! Her kommer noen øyeblikksbilder i fra laben:

IMGP0325

Ferdig etiketterte prøver

Ferdig etiketterte prøver

Vi har hatt flink sommerhjelp her som har jobbet med å få skikkelig orden på en del av det afrikanske materialet som vi har sendt inn til barcoding. Nå har krabbene derifra fått sine permanente museumsetiketter og kan lagres på en forsvarlig måte.

 

Barcodingsplate med vevsprøver

Barcodingsplate med vevsprøver

 

Seks plater med vevsprøver klare til innsending

Seks plater med vevsprøver klare til innsending

 

NorBOL-barcodingen fortsetter for fullt, og nå er seks nye brett med børstemark klare til innsending for sekvensering.

Vi samarbeider også med et ForBio-kurs som skal holdes på feltstasjonen vår på Espegrend; der skal deltagerne arbeide med tareskog som habitat, og lære seg identifisering av makroalger og fauna som lever i tilknytning til taren. Vi skal ut en tur og holde foredrag om barcodingen av marine evertebrater som avdelingen driver med, og kursdeltakerne vil plukke passende dyr til prosjektet.

Capture

Sortering

Sortering

"noen" børstemark

“Noen” børstemark i fra en stasjon i fra årets  påsketokt

Videre så har vi – som alltid – prøver som skal sorteres, for øyeblikket går det i MAREANO-prøver i fra Barentshavet, og de er fulle av interessante arter!