DNA-strekkoding på NRK, og toktdagbøker i fra MAREANO

I går gikk det et kjempefint innslag om DNA-strekkoding (barcoding) på Scrödingers katt på NRK, det kan du se på nett-TV her:

DNA strekkode avslører nye arter

Samtidig så avsluttet MAREANO årets siste tokt med bio/geo innsamling. De har vært aktive på nett underveis, her finner du årets siste toktdagbok, som ble laget med en liten vri:

“I dette nyhetsbrevet har alle biologene som er med på “G.O.Sars” på toktet nå i august-september bidratt. Hver biolog har valgt et bilde fra arbeidet sitt, og har skrevet historien til det. Her er mange forskjellige stemmer – og det reflekterer både den store diversiteten vi finner på havbunnen – og den store diversiteten blant biologene om bord”

Nytt dagsturstokt

Helt greit “kontor”, det her – flat sjø og blå himmel!

I går var vi ute i sola med F/F “Hans Brattstrøm” igjen, denne gangen på nokså spesifikk jakt etter noen børstemarkarter som vi gjerne skulle hatt mer materiale av – skjønt vi naturligvis plukker med oss “litt av alt” når vi først er ute.

Med oss hadde vi to av avdelingens studenter – praktisk felterfaring er viktig å få med seg i løpet av en grad!

Med slike små dyr som vi jobber med så er det oftest ikke før en sitter med prøven under lupen at en kan si sikkert om en har funnet det en er ute etter (eller kanskje noe helt annet spennende!), så vi kommer som oftest hjem med bøttevis av materiale – gårsdagen var intet unntak der.

I dag er det frenetisk sortering og fiksering på programmet, og jeg forsøker å få tatt bilder av en del levende dyr, da fargetegningene i stor grad forsvinner i spritfikseringen. Vi plukker dyr direkte til DNA-barcoding, stort ferskere prøver går det ikke an å få !

Skattejakt på dekk

Et eksempel i fra fangsten; en børstemark i familien Cirratulidae

Internasjonal Crustacea kongress (ICC-8) i Frankfurt

Nesten 300 forskere fra mange nasjoner var i forrige uke samlet på den flotte Campus Westend til Goetheuniversitetet i Frankfurt for den Åttende Internationale Crustace-kongressen. Mange interessante foredrag og postere med høy kvalitet ble presentert i løpet av seks dager. En spesiell work-shop om DNA-identifikasjon fylte auditoriet i den grad at mange tilhørere måtte nøye seg med ståplass. EW ga en 15 minutters presentasjon av resultater fra vår strekkoding av decapoder og stomatopoder fra Afrikakysten. Han peikte særlig på at strekkoding kan avsløre avvikende identifikasjoner mellom ulike laboratorier og forskningsmiljø og vise til behov for rebestemmelse og / eller taksonomisk revisjon av arter. Copy of GoetheUnivFrankfurt ICC-8_presentation

Casinobygget ved Goethe-universitetet

Kenneth Meland (BIO, UiB) framla også resultater av fylogenetiske analyser av den eldgamle gruppen Lophogastrida. Separate analyser av morfologiske karakterer og DNA fra fire gener viser overraskende godt samsvar og har gitt oss en ny forståelse av slektskapsforhold mellom familiene i denne gruppen. Meland samarbeider med EW og Stefan Richter (Univ. Rostock) i dette prosjektet. ICC8_Lophogastrida

Data til Artskart

4027 artsdata om marine krepsdyr i Universitetsmuseets samlinger ble avlevert til Artsdatabanken i dag

Artsdatabanken (http://www.artsdatabanken.no/) lyser jevnlig ut midler for å få stedfestede data om forekomsten av arter i Norge. Selv om Evertebratsamlingen har preparater av flere tusen arter som har vært katalogiserte siden 1850, er mange prøver som ikke uten videre egner seg for slike kart. Det kan blant annet være fordi stedsangivelsene er usikre. Vi har foretatt et utvalg av 4000 prøver av storkreps (Malacostraca) som vi anser som rimelig sikre identifikasjoner. Data ble avlevert til Artsdatabanken i dag og vil formodentlig bli integrert i Artskart og GBIF. Vi takker Artsdatabanken for oppdraget.

Artsidentifiserte og katalogiserte prøver med data i DarwinCore-format

Sommertravelt

Det er fellesferie og stille i gangene på Museet, men vi som er på jobb har nok å henge fingrene i! Her kommer noen øyeblikksbilder i fra laben:

Ferdig etiketterte prøver

Vi har hatt flink sommerhjelp her som har jobbet med å få skikkelig orden på en del av det afrikanske materialet som vi har sendt inn til barcoding. Nå har krabbene derifra fått sine permanente museumsetiketter og kan lagres på en forsvarlig måte.

Barcodingsplate med vevsprøver

Seks plater med vevsprøver klare til innsending

NorBOL-barcodingen fortsetter for fullt, og nå er seks nye brett med børstemark klare til innsending for sekvensering.

Vi samarbeider også med et ForBio-kurs som skal holdes på feltstasjonen vår på Espegrend; der skal deltagerne arbeide med tareskog som habitat, og lære seg identifisering av makroalger og fauna som lever i tilknytning til taren. Vi skal ut en tur og holde foredrag om barcodingen av marine evertebrater som avdelingen driver med, og kursdeltakerne vil plukke passende dyr til prosjektet.

Sortering

“Noen” børstemark i fra en stasjon i fra årets påsketokt

Videre så har vi – som alltid – prøver som skal sorteres, for øyeblikket går det i MAREANO-prøver i fra Barentshavet, og de er fulle av interessante arter!